Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEFVO15553 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEFVO15553 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEFVO15553 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEFVO15553 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MEFVO15553 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEFVO15553 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEFVO15553 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEFVO15553 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEFVO15553 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEFVO15553 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEFVO15553 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEFVO15553 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEFVO15553 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEFVO15553 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MEFVO15553 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MEFVO15553 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MEFVO15553 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MEFVO15553 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEFVO15553 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEFVO15553 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEFVO15553 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEFVO15553 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEFVO15553 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEFVO15553 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEFVO15553 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEFVO15553 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEFVO15553 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEFVO15553 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEFVO15553 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEFVO15553 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEFVO15553 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEFVO15553 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEFVO15553 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEFVO15553 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEFVO15553 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEFVO15553 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEFVO15553 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MEFVO15553 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEFVO15553 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEFVO15553 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MEFVO15553 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEFVO15553 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEFVO15553 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEFVO15553 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEFVO15553 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEFVO15553 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEFVO15553 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEFVO15553 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEFVO15553 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MEFVO15553 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MEFVO15553 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEFVO15553 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEFVO15553 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEFVO15553 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEFVO15553 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEFVO15553 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEFVO15553 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEFVO15553 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEFVO15553 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEFVO15553 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEFVO15553 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEFVO15553 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEFVO15553 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEFVO15553 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEFVO15553 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEFVO15553 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEFVO15553 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEFVO15553 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MEFVO15553 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEFVO15553 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEFVO15553 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEFVO15553 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MEFVO15553 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEFVO15553 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEFVO15553 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MEFVO15553 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEFVO15553 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MEFVO15553 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEFVO15553 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEFVO15553 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEFVO15553 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEFVO15553 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEFVO15553 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEFVO15553 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEFVO15553 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEFVO15553 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEFVO15553 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEFVO15553 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEFVO15553 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEFVO15553 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEFVO15553 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEFVO15553 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEFVO15553 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEFVO15553 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEFVO15553 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEFVO15553 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEFVO15553 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEFVO15553 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEFVO15553 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms