Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NUPL2O15504 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUPL2O15504 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUPL2O15504 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUPL2O15504 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUPL2O15504 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUPL2O15504 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUPL2O15504 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUPL2O15504 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUPL2O15504 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUPL2O15504 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms