Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KPNA3O00505 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms