Protein–RNA interactions for Protein: O00237

RNF103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF103O00237 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF103O00237 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF103O00237 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF103O00237 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF103O00237 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF103O00237 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF103O00237 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF103O00237 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF103O00237 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF103O00237 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF103O00237 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF103O00237 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF103O00237 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF103O00237 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF103O00237 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF103O00237 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF103O00237 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF103O00237 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF103O00237 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF103O00237 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF103O00237 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF103O00237 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF103O00237 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF103O00237 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF103O00237 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF103O00237 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF103O00237 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF103O00237 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF103O00237 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF103O00237 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF103O00237 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF103O00237 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF103O00237 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF103O00237 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF103O00237 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF103O00237 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF103O00237 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF103O00237 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF103O00237 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF103O00237 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF103O00237 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF103O00237 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF103O00237 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF103O00237 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF103O00237 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF103O00237 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF103O00237 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF103O00237 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF103O00237 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF103O00237 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF103O00237 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF103O00237 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF103O00237 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF103O00237 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF103O00237 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF103O00237 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF103O00237 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF103O00237 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF103O00237 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF103O00237 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF103O00237 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF103O00237 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF103O00237 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF103O00237 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF103O00237 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF103O00237 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF103O00237 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF103O00237 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF103O00237 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF103O00237 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF103O00237 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF103O00237 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF103O00237 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF103O00237 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF103O00237 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF103O00237 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF103O00237 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF103O00237 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF103O00237 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF103O00237 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RNF103O00237 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF103O00237 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF103O00237 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF103O00237 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF103O00237 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF103O00237 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF103O00237 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF103O00237 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF103O00237 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF103O00237 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF103O00237 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF103O00237 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF103O00237 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF103O00237 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF103O00237 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF103O00237 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF103O00237 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF103O00237 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF103O00237 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF103O00237 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms