Protein–RNA interactions for Protein: A6NLX3

SPDYE4, Speedy protein E4, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE4A6NLX3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPDYE4A6NLX3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDYE4A6NLX3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms