Protein–RNA interactions for Protein: A6NI28

ARHGAP42, Rho GTPase-activating protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP42A6NI28 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARHGAP42A6NI28 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP42A6NI28 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms