Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PGPEP1LA6NFU8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGPEP1LA6NFU8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms