Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HELTA6NFD8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms