Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MAP1LC3B2A6NCE7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms