Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
VPS37CA5D8V6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VPS37CA5D8V6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms