Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G8

TRBV10-2, T-cell receptor beta variable 10-2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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