Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 HACD3-201ENST00000261875 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 ZNF143-203ENST00000396602 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 WIPF3-201ENST00000242140 4184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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TRAF6Q9Y4K3 C3orf56-201ENST00000624688 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TRAF6Q9Y4K3 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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