Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 NLGN3-205ENST00000536169 3863 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AP2A1-202ENST00000359032 3286 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 PLSCR1-201ENST00000342435 2233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL279P-201ENST00000582185 284 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AL645504.1-201ENST00000429443 1809 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 LIMK1-201ENST00000336180 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHA6-202ENST00000414478 5091 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP25-202ENST00000409202 2945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 TMEM8B-201ENST00000377988 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 RNPC3-202ENST00000524631 2013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 GRM8-201ENST00000339582 4057 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 NFIB-206ENST00000397575 2869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SPOCK3Q9BQ16 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms