Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 NBR1-205ENST00000589872 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AGO2-205ENST00000519980 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP36-202ENST00000370921 2447 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 PAK5-203ENST00000378429 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 RNF144B-201ENST00000259939 5036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 HERC2P3-204ENST00000426501 5995 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 ZNF44-202ENST00000355684 2119 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 PRKN-206ENST00000366898 4180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 RPS10P7-201ENST00000441932 2329 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AFG3L2P1-201ENST00000521792 1763 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 PCDH20-201ENST00000409204 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 CTAGE5-202ENST00000280083 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 ABCF2-201ENST00000222388 2185 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 IKZF1-201ENST00000331340 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 SEPT2-204ENST00000391973 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 ANKRD20A4-201ENST00000357336 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 ZNF789-209ENST00000483089 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 TRAF5-203ENST00000367004 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 NFATC1-202ENST00000318065 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 PKD1L2-210ENST00000533478 5669 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 HJURP-202ENST00000411486 3187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 SLC38A1-206ENST00000549049 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 GTF2I-218ENST00000620879 4352 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 ZNF630-206ENST00000442455 2829 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 HEY2-202ENST00000368365 2461 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 IL10RA-201ENST00000227752 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AAK1-201ENST00000406297 4499 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 HLCS-202ENST00000399120 6466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 ANXA11-205ENST00000438331 6965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 NR1I2-202ENST00000393716 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 ALOX5-207ENST00000542434 2390 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 P4HA1-201ENST00000263556 2844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 P4HA1-204ENST00000394890 2844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 LINC00540-203ENST00000631321 2412 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 SETD7-201ENST00000274031 7365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 XAB2-201ENST00000358368 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AC008609.1-202ENST00000501818 2686 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 DOCK10-201ENST00000258390 7260 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 DOCK4-204ENST00000428084 7997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 MYO10-210ENST00000513610 8038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 GREB1-204ENST00000381486 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 DAND5-201ENST00000317060 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 USP33-204ENST00000370794 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 HDAC7-230ENST00000552960 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 ENTPD3-203ENST00000445129 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 PLXNA3-201ENST00000369682 10885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 C1S-221ENST00000617865 2844 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 LINC01561-201ENST00000369071 2176 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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