Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 SLIRP-209ENST00000557342 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 SLIRP-211ENST00000557623 865 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 CR936218.2-201ENST00000574252 759 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AL138762.1-201ENST00000608554 1637 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 PPARA-202ENST00000402126 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AIFM1P1-201ENST00000413342 1841 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 TPT1-201ENST00000309246 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 OR2T34-201ENST00000328782 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 OR2T3-201ENST00000359594 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AC010997.3-201ENST00000418818 502 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AL353803.1-201ENST00000439014 800 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 HNRNPA1P30-202ENST00000440699 997 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 CHCHD10-204ENST00000520222 384 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AC136475.6-201ENST00000533113 289 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 HP-215ENST00000569639 568 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 MIR378I-201ENST00000582688 76 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 CD27-AS1-209ENST00000545339 1766 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 RBM4-202ENST00000396053 1337 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AC006262.1-201ENST00000593980 1316 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 GPR119-201ENST00000276218 1008 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 HMGB1-202ENST00000339872 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 TRGV2-201ENST00000426402 544 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 MYOZ3-205ENST00000520112 605 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AL121790.2-201ENST00000553425 379 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 IDH3A-207ENST00000558554 1595 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AC133548.2-202ENST00000562267 148 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 MT1G-204ENST00000569500 305 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AP002414.5-201ENST00000591853 258 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 LINC01206-212ENST00000609168 988 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 CD74-201ENST00000009530 981 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIRT1Q96EB6 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 PPP1R32-203ENST00000432063 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 TARS2-214ENST00000606933 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 BCO2-202ENST00000361053 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 TACC1-208ENST00000520340 1976 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AC105415.1-201ENST00000509015 1416 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms