Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 AFG3L2P1-201ENST00000521792 1763 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASP4P49662 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 TRMT10B-203ENST00000377754 1881 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 PICART1-201ENST00000499842 2533 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 TRIM37-203ENST00000393066 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 SOX30-203ENST00000519442 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 ZDHHC8P1-202ENST00000418264 1403 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 AL356130.1-201ENST00000620188 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 SFTPA1-203ENST00000428376 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASP4P49662 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP4P49662 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP4P49662 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP4P49662 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP4P49662 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP4P49662 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP4P49662 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP4P49662 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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CASP4P49662 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP4P49662 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP4P49662 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP4P49662 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP4P49662 CCDC175-201ENST00000281581 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP4P49662 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP4P49662 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP4P49662 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP4P49662 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP4P49662 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP4P49662 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP4P49662 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP4P49662 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP4P49662 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP4P49662 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP4P49662 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP4P49662 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP4P49662 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP4P49662 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP4P49662 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP4P49662 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP4P49662 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP4P49662 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP4P49662 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASP4P49662 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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