Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 CDX2-201ENST00000381020 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 FCHSD1-201ENST00000435817 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 THUMPD3-206ENST00000452837 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 CCT8-201ENST00000286788 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 DLG5-201ENST00000372391 7415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 MOV10-204ENST00000413052 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 GABBR1-203ENST00000377012 4104 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 FAM200B-223ENST00000622362 4377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 KCNAB2-201ENST00000164247 4273 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 GRAMD1B-215ENST00000638086 2665 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 LDLR-205ENST00000557933 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 TCF4-276ENST00000635822 7805 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AL022238.4-201ENST00000639722 4563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 PCGF2-204ENST00000616199 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 G2E3-202ENST00000438909 2334 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 RABGAP1L-207ENST00000367690 1815 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 PNPLA6-203ENST00000450331 4457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 SORBS3-201ENST00000240123 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 PIGG-203ENST00000453061 3218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AL135999.1-201ENST00000555968 3243 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 CHID1-205ENST00000454838 3255 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 ZNF221-205ENST00000622072 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 2500 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 CHMP3-201ENST00000263856 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 PRPF40B-202ENST00000380281 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 PLAGL1-209ENST00000444202 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 SERPINA1-205ENST00000404814 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 SLC45A4-203ENST00000519067 7483 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 MAMLD1-201ENST00000262858 4607 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 FSTL1-202ENST00000424703 1396 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 PRKAR1A-217ENST00000589228 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 CTPS1-202ENST00000372621 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 ST3GAL6-228ENST00000613264 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 KIAA0556-201ENST00000261588 6616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 LINC00662-206ENST00000590523 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 HIST1H2BH-201ENST00000619466 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 ARL8B-202ENST00000419534 1684 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 RHBDL2-201ENST00000289248 2129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 PRKCQ-203ENST00000539722 3224 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 MON2-212ENST00000552115 3760 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 ZNF266-206ENST00000592292 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 EFHC1-224ENST00000636702 2197 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 ZNF23-201ENST00000357254 3186 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 AP3S2-201ENST00000336418 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 CAPN1-208ENST00000527323 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 ZNF286A-203ENST00000421016 5541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 ST3GAL5-204ENST00000393808 2236 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SMIM3Q9BZL3 PLEKHG5-208ENST00000400915 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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