Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 MBL3P-201ENST00000402234 644 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 OR7E37P-201ENST00000421076 897 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 C5orf38-203ENST00000457752 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 EEF1GP2-201ENST00000509352 1243 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC100797.1-201ENST00000520760 316 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AL353997.3-201ENST00000586597 589 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 WASH5P-206ENST00000632506 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 MPI-208ENST00000563786 1707 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 GUCY1A3-213ENST00000621234 1788 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 VRK3-205ENST00000593919 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 PTAFR-201ENST00000305392 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 ZFP69B-201ENST00000361584 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 DRD3-204ENST00000467632 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 MED27-201ENST00000292035 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 TIMM23B-201ENST00000374098 1142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 SUSD3-201ENST00000375469 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 TXNRD3NB-201ENST00000404489 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC004771.2-201ENST00000430920 439 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 TEPP-202ENST00000441824 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 RBP5-202ENST00000542370 564 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 DEGS2-202ENST00000553834 421 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC133539.1-201ENST00000562644 420 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC106782.3-201ENST00000563429 258 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 SNORD55-201ENST00000581525 80 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 PSME3-213ENST00000592169 826 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 MIR7704-201ENST00000610524 59 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AL591926.3-201ENST00000611630 238 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.64-201ENST00000611904 268 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC093495.1-215ENST00000626655 821 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AL138762.1-201ENST00000608554 1637 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 FHL2-208ENST00000409807 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 APTX-203ENST00000379813 1121 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 IGHV1-45-201ENST00000390621 411 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 SYCP3-203ENST00000392927 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 TMEM18-203ENST00000405941 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AL078621.2-201ENST00000419351 698 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 HNRNPA1P30-202ENST00000440699 997 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AL359915.1-201ENST00000457719 898 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 APTX-220ENST00000476858 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 NDUFC1-206ENST00000505036 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 KCNE3-202ENST00000525550 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 ATP2A2-211ENST00000552636 529 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AL133453.1-201ENST00000554055 581 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 PMM2-216ENST00000569958 698 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 MIR1587-201ENST00000583319 53 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 OAS1-201ENST00000202917 1816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 HRC-203ENST00000595625 2044 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 SEC22C-205ENST00000417572 1513 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 FDFT1-218ENST00000530664 1761 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CACNA1SQ13698 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms