Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASIC1P78348 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASIC1P78348 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASIC1P78348 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASIC1P78348 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASIC1P78348 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASIC1P78348 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASIC1P78348 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASIC1P78348 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASIC1P78348 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASIC1P78348 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASIC1P78348 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ASIC1P78348 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
ASIC1P78348 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 CUL2-210ENST00000626172 4115 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 TXNRD1-214ENST00000526691 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ASIC1P78348 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ASIC1P78348 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms