Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 RBM15-204ENST00000617047 3284 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 SRSF5-205ENST00000553635 1412 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
GGCXP38435 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
GGCXP38435 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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