Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYCNP04198 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYCNP04198 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYCNP04198 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYCNP04198 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MYCNP04198 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 AC008514.2-201ENST00000522096 1337 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 MYOCOS-204ENST00000637642 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 GABRB3-205ENST00000545868 1267 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 RPL17-207ENST00000580210 705 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 AC119674.1-209ENST00000642031 997 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 PLAC8-201ENST00000311507 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MYCNP04198 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCNP04198 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCNP04198 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCNP04198 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCNP04198 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCNP04198 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCNP04198 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCNP04198 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCNP04198 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCNP04198 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCNP04198 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCNP04198 AC011525.2-202ENST00000590611 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCNP04198 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCNP04198 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCNP04198 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCNP04198 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCNP04198 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCNP04198 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCNP04198 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCNP04198 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCNP04198 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCNP04198 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCNP04198 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCNP04198 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCNP04198 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCNP04198 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCNP04198 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCNP04198 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCNP04198 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCNP04198 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCNP04198 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCNP04198 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MYCNP04198 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms