Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms