Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 PEX5-201ENST00000266563 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 HMGB1-202ENST00000339872 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC006144.1-201ENST00000424220 1600 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 CPA5-203ENST00000461828 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC139491.6-202ENST00000637171 2077 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 SERPINA1-205ENST00000404814 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 HPGD-204ENST00000504433 1910 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 ARHGEF3-213ENST00000496106 1994 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CUL4BQ13620 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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