Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 NPHS1-202ENST00000378910 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 FETUB-201ENST00000265029 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 TXNRD1-214ENST00000526691 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 RBM24-201ENST00000318204 2394 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 RAD52-204ENST00000430095 2366 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 RBMY2FP-201ENST00000303922 2042 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 BAIAP2-AS1-202ENST00000577066 4465 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 KCTD7-209ENST00000640385 4118 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 TTC39B-202ENST00000380850 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 SLC2A4-201ENST00000317370 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 C3orf56-201ENST00000624688 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 TNIP1-218ENST00000523338 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AC005072.1-201ENST00000606640 1779 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 FAM13C-201ENST00000422313 1963 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 CPSF3-202ENST00000460593 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ERVK13-1-205ENST00000568395 5578 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 IGSF9-202ENST00000368094 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 FBLN5-201ENST00000267620 2423 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 HRC-203ENST00000595625 2044 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 SERPINA1-205ENST00000404814 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 RNF4-201ENST00000314289 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 EZR-201ENST00000337147 3068 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 GOT2-201ENST00000245206 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ZNF300-205ENST00000446148 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AL118508.3-201ENST00000623468 1854 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 PDE9A-207ENST00000398224 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 PDE9A-210ENST00000398229 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 DDR1-226ENST00000376569 3783 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ZNF75D-201ENST00000370764 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 WASF3-201ENST00000335327 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 BSND-201ENST00000371265 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 CADM3-202ENST00000368125 3745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 SCML1-201ENST00000380041 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ZNF169-202ENST00000395395 1986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 CICP26-201ENST00000425003 2448 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 PCDHB7-201ENST00000231137 3765 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AL135960.1-201ENST00000422216 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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