Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 GOLGA8G-203ENST00000525590 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AC078878.2-201ENST00000543451 286 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 KRTAP10-11-201ENST00000334670 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 RPS7-202ENST00000403564 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 POLR2F-202ENST00000405557 560 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AC114781.1-201ENST00000450559 1028 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 COPS5-203ENST00000517736 1621 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 C2orf27AP1-201ENST00000618128 586 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms