Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMTNP53814 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMTNP53814 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMTNP53814 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMTNP53814 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SMTNP53814 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMTNP53814 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMTNP53814 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMTNP53814 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMTNP53814 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMTNP53814 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMTNP53814 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMTNP53814 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMTNP53814 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 CUL2-210ENST00000626172 4115 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMTNP53814 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms