Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 USP11-204ENST00000377107 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 C5orf15-201ENST00000231512 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 GIMAP1-GIMAP5-201ENST00000611999 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 SOX30-203ENST00000519442 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 LDLR-207ENST00000558013 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 P2RX1-201ENST00000225538 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 HACD3-201ENST00000261875 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 KCNMA1-241ENST00000638606 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 KCNMA1-279ENST00000640182 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 AC004471.2-201ENST00000609936 1514 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 ENO2-209ENST00000538763 1646 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 RNF214-205ENST00000531287 1706 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 AC009108.4-201ENST00000623284 2451 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 AQP7-205ENST00000379507 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 MRPL27-201ENST00000225969 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 AL365203.1-201ENST00000450890 1048 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 C12orf56-201ENST00000333722 3936 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 DNMT3A-202ENST00000321117 4279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 TXNRD1-202ENST00000388854 4277 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 CDK5RAP1-201ENST00000339269 1891 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 TGOLN2-206ENST00000444342 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 PCSK7-215ENST00000540028 3332 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 CRHR1-206ENST00000398285 2399 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 HIF3A-204ENST00000300862 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 AC105402.3-202ENST00000446781 2592 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 R3HDM2-215ENST00000634871 4092 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 C20orf96-203ENST00000400269 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 CEACAM20-206ENST00000621342 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 ZNF221-205ENST00000622072 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 AP001046.1-201ENST00000435702 2816 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
POLR2KP53803 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms