Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 SYCE1-201ENST00000303903 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AIMP2-203ENST00000400479 1107 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 TMEM18-203ENST00000405941 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 ATP6AP2-202ENST00000423649 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 MTND6P7-201ENST00000433237 524 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 IQCJ-202ENST00000451172 885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC016304.1-201ENST00000476363 413 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 OCIAD1-226ENST00000513391 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 MNAT1-202ENST00000539616 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AZU1P1-201ENST00000603479 385 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC123595.2-201ENST00000607854 549 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 IFI27-214ENST00000620396 599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AL137028.1-201ENST00000620521 555 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 LINC01988-202ENST00000636975 921 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 PEX11B-203ENST00000537888 1632 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 KIR2DL4-204ENST00000359085 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 CUL2-210ENST00000626172 4115 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 DDX6P2-201ENST00000619520 1455 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 OR4C6-201ENST00000314259 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 GSTK1-201ENST00000358406 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 HSD17B3-201ENST00000375262 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 HBD-202ENST00000380299 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 IGLV3-21-201ENST00000390308 602 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 ARF1P2-201ENST00000392493 538 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 CNTFR-AS1-201ENST00000436360 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 CNTFR-AS1-203ENST00000453642 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC140481.2-201ENST00000457169 695 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 RN7SL105P-201ENST00000475661 299 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC007992.1-201ENST00000513953 953 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 CSRP1-219ENST00000533432 1149 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AL391832.3-201ENST00000549744 846 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 NPLOC4-214ENST00000573876 560 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 SNHG15-210ENST00000585030 953 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 ACKR1-202ENST00000368122 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
POLD1P28340 FAM90A22P-201ENST00000400142 1395 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 TUBB8P5-201ENST00000445286 1351 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 FMR1-218ENST00000621447 1832 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 ZNF114-201ENST00000315849 2206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 C1QTNF9B-201ENST00000382137 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 KRT41P-201ENST00000393988 1293 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 HIST1H2BN-201ENST00000396980 432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 MRPL23-203ENST00000397294 551 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 CR769775.1-203ENST00000399894 579 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC064836.1-201ENST00000405197 704 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC079742.1-201ENST00000434951 357 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 OR5BA1P-201ENST00000529722 982 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
POLD1P28340 TMEM253-206ENST00000556585 1236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms