Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPM2P07951 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPM2P07951 LINC01209-201ENST00000451289 2400 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPM2P07951 OSBP2-203ENST00000403222 3728 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPM2P07951 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPM2P07951 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPM2P07951 AC135050.1-201ENST00000622229 3380 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPM2P07951 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPM2P07951 SUCLG2-201ENST00000307227 2352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPM2P07951 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPM2P07951 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPM2P07951 ARMCX2-203ENST00000356824 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPM2P07951 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPM2P07951 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPM2P07951 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPM2P07951 AIF1L-204ENST00000372300 3284 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPM2P07951 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 PHB-215ENST00000617874 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 ZNF630-206ENST00000442455 2829 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 AL162231.4-201ENST00000564224 3264 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 EBF2-203ENST00000520164 5145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 SGK1-220ENST00000524929 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 ZNF106-205ENST00000565611 5081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 GOLGA6L7P-201ENST00000567390 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 USP20-202ENST00000358355 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPM2P07951 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TPM2P07951 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPM2P07951 SHC1-203ENST00000368449 2879 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPM2P07951 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPM2P07951 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPM2P07951 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPM2P07951 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPM2P07951 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPM2P07951 MCM3-202ENST00000419835 2523 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPM2P07951 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPM2P07951 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TPM2P07951 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPM2P07951 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPM2P07951 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TPM2P07951 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TPM2P07951 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPM2P07951 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TPM2P07951 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPM2P07951 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPM2P07951 WSCD2-201ENST00000332082 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPM2P07951 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TPM2P07951 FAS-204ENST00000355740 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPM2P07951 ENOX2-201ENST00000338144 4263 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPM2P07951 ARHGAP36-202ENST00000370921 2447 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TPM2P07951 FERMT2-201ENST00000341590 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TPM2P07951 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TPM2P07951 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TPM2P07951 DQX1-201ENST00000393951 2540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TPM2P07951 DDB2-201ENST00000256996 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TPM2P07951 CHRNA1-208ENST00000636168 1862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TPM2P07951 MTUS2-206ENST00000612955 7430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TPM2P07951 SPATA2-201ENST00000289431 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TPM2P07951 C1QTNF3-201ENST00000231338 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 OACYLP-201ENST00000417918 2208 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 CD36-207ENST00000432207 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TPM2P07951 AC138150.2-201ENST00000589796 2053 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms