Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 NBR1-202ENST00000542611 2703 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 GPR17-206ENST00000544369 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 LVRN-201ENST00000357872 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 NUAK2-201ENST00000367157 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ACOX2-201ENST00000302819 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AC008676.1-201ENST00000508443 1932 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ITGAL-203ENST00000433423 1416 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ZNF23-201ENST00000357254 3186 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 HECW1-IT1-201ENST00000322220 1839 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AL590483.3-201ENST00000623669 3580 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 PPARG-206ENST00000397012 2006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 DCAKD-203ENST00000452796 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ENC1-206ENST00000537006 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 SNAI1-201ENST00000244050 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ADGRE5-203ENST00000358600 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 SLC12A8-202ENST00000430155 2831 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 RIPK3-201ENST00000216274 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 NTRK3-204ENST00000360948 3004 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AKR1B10-201ENST00000359579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 MCM3-202ENST00000419835 2523 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 CAPN10-AS1-201ENST00000567819 4000 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 SCNN1D-202ENST00000338555 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AP000229.1-201ENST00000608591 1979 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ARHGAP25-201ENST00000409030 2936 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ARHGAP25-203ENST00000409220 2939 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 MVK-213ENST00000625889 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 DDC-206ENST00000431062 1620 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 INTS9-201ENST00000416984 2759 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 PAAF1-215ENST00000544909 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 SRP68-212ENST00000602720 2037 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AL445647.1-201ENST00000606221 3599 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 PCDHGA9-201ENST00000573521 4605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 AGAP6-203ENST00000618025 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 PTGR2-205ENST00000555661 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNFSF18Q9UNG2 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms