Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC006033.2-201ENST00000609522 1968 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
HERC3Q15034 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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