Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AL365203.1-201ENST00000450890 1048 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 MED24-212ENST00000501516 3037 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ARHGAP27-202ENST00000376922 3628 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 PMEL-215ENST00000550464 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 COL22A1-203ENST00000435777 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 TRPC3-205ENST00000513531 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 DNAJA4-201ENST00000343789 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 RAP1GAP-201ENST00000290101 3584 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 FOSB-204ENST00000585836 3550 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ERCC1-202ENST00000300853 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 WASH2P-201ENST00000453662 1684 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 NRXN1-233ENST00000630543 4500 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 KLC2-202ENST00000394065 3755 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 TRAK1-206ENST00000449246 3260 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 PRDM7-202ENST00000449207 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 EPB41L2-205ENST00000445890 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 SH2D2A-203ENST00000392306 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC007622.2-202ENST00000546714 1680 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 RNF24-202ENST00000358395 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 EME1-201ENST00000338165 2339 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ARSK-201ENST00000380009 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 A1CF-203ENST00000373995 2211 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AP003108.3-201ENST00000623765 2234 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 RP2-201ENST00000218340 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 FAM71F1-201ENST00000315184 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AXIN1-202ENST00000354866 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 TRAF3IP2-202ENST00000359831 2264 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 NPNT-202ENST00000379987 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ZNF488-202ENST00000591025 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 CELF4-203ENST00000420428 4052 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 B3GALT5-204ENST00000398714 2341 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 NUTM2B-202ENST00000372321 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 DCLRE1C-208ENST00000378258 2463 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 CYP1A1-202ENST00000395048 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 CAPN10-AS1-201ENST00000567819 4000 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 PDXDC2P-NPIPB14P-205ENST00000531894 4184 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ZNF730-202ENST00000597761 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 ELN-201ENST00000252034 3781 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 SIGLEC10-209ENST00000525998 1841 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LSAMPQ13449 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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