Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 ARNTL-202ENST00000401424 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPN2P17655 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms