Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 AP000343.1-201ENST00000440602 385 ntBASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 AP003108.1-201ENST00000534856 554 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 AC126177.4-201ENST00000547452 731 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 MFSD12-215ENST00000615613 688 ntBASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 MIR324-201ENST00000362183 83 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 416 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 TEDDM2P-201ENST00000414169 786 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 RN7SL638P-201ENST00000494527 290 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 AC100858.2-201ENST00000531948 487 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 AC027228.1-201ENST00000560094 325 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 AC025048.4-201ENST00000589740 699 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 GAS6-AS2-201ENST00000608651 1952 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 ZNF582-201ENST00000301310 2824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 CDK7-201ENST00000256443 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
EPCAMP16422 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms