Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC119674.2-203ENST00000642129 1675 ntAPPRIS P5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
HERC3Q15034 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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