Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 PNPLA7-202ENST00000406427 4806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 TMX1-201ENST00000457354 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 RAB43-203ENST00000393305 4215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ZNF701-204ENST00000540331 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ABCA3-201ENST00000301732 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 HS6ST1-201ENST00000259241 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 DNM3-208ENST00000627582 7625 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
TMEM225BP0DP42 SLC26A4-201ENST00000265715 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
TMEM225BP0DP42 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms