Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SCN2BO60939 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SCN2BO60939 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SCN2BO60939 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SCN2BO60939 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SCN2BO60939 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SCN2BO60939 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SCN2BO60939 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SCN2BO60939 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SCN2BO60939 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SCN2BO60939 AC138150.2-201ENST00000589796 2053 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SCN2BO60939 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SCN2BO60939 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SCN2BO60939 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SCN2BO60939 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SCN2BO60939 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SCN2BO60939 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SCN2BO60939 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SCN2BO60939 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SCN2BO60939 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SCN2BO60939 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SCN2BO60939 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SCN2BO60939 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SCN2BO60939 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SCN2BO60939 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SCN2BO60939 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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SCN2BO60939 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SCN2BO60939 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SCN2BO60939 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SCN2BO60939 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SCN2BO60939 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SCN2BO60939 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SCN2BO60939 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SCN2BO60939 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SCN2BO60939 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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SCN2BO60939 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SCN2BO60939 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SCN2BO60939 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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