Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AC073610.2-201ENST00000537495 406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 COPZ1-207ENST00000549116 736 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 PSME2-213ENST00000560410 755 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 PDZRN3-AS1-202ENST00000608304 774 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC006581.2-201ENST00000631830 455 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 FURIN-208ENST00000640725 224 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 IGHV1-45-201ENST00000390621 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 MIR646HG-204ENST00000427820 805 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC022733.2-201ENST00000520487 531 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 MEG8_2.1-201ENST00000610604 122 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 VRK3-205ENST00000593919 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC020914.1-201ENST00000396477 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 HTR4-201ENST00000360693 3082 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 MEMO1-207ENST00000426310 1336 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 PBDC1-202ENST00000373358 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AL391987.4-201ENST00000377547 439 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AP001625.3-201ENST00000416179 449 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC003072.1-201ENST00000510957 612 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 CD63-212ENST00000552067 621 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 SKAP1-AS1-201ENST00000582246 687 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 RN7SK-201ENST00000636484 328 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 ERGIC3-220ENST00000640748 832 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 NR1I2-207ENST00000640105 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AL356414.1-201ENST00000379526 686 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 LINC00299-203ENST00000444688 537 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC073465.1-201ENST00000456671 464 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC008040.3-201ENST00000493762 1232 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 RN7SL833P-201ENST00000498758 284 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 VAMP1-204ENST00000535180 747 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 Z93930.2-203ENST00000585003 516 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC244154.1-201ENST00000620148 1555 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 KLK8-201ENST00000291726 853 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AL355987.2-201ENST00000471502 561 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 LINC01606-208ENST00000521653 557 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC021439.1-201ENST00000562975 591 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC007731.1-203ENST00000583722 474 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 ZNF544-209ENST00000596929 543 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 BID-211ENST00000611040 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 FAM230A-201ENST00000615181 315 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AL513478.3-201ENST00000641038 1095 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 MEF2C-207ENST00000503554 1345 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 CSMD2-202ENST00000338325 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 DMKN-202ENST00000392206 458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 OR10AA1P-201ENST00000417823 937 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 PHBP11-201ENST00000420550 809 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 COQ5-202ENST00000445328 992 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 ZEB1-AS1-207ENST00000606286 476 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AP000553.1-201ENST00000610143 430 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 SARS2-205ENST00000594171 1631 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 IQCD-201ENST00000299732 1369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 FPGT-202ENST00000370898 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 JPX-207ENST00000602772 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 TMIGD1-201ENST00000328886 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 U3.49-201ENST00000391065 214 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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