Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDY1Q9Y6F8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDY1Q9Y6F8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms