Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PARP3Q9Y6F1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PARP3Q9Y6F1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PARP3Q9Y6F1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms