Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX8Q9Y5X2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNX8Q9Y5X2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.3 ms