Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3R0

GRIP1, Glutamate receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIP1Q9Y3R0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIP1Q9Y3R0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GRIP1Q9Y3R0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms