Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRELID3BQ9Y3B1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms