Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CEP164Q9UPV0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
CEP164Q9UPV0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CEP164Q9UPV0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CEP164Q9UPV0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
CEP164Q9UPV0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CEP164Q9UPV0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CEP164Q9UPV0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CEP164Q9UPV0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CEP164Q9UPV0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CEP164Q9UPV0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CEP164Q9UPV0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CEP164Q9UPV0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CEP164Q9UPV0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CEP164Q9UPV0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CEP164Q9UPV0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CEP164Q9UPV0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CEP164Q9UPV0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CEP164Q9UPV0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CEP164Q9UPV0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CEP164Q9UPV0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
CEP164Q9UPV0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CEP164Q9UPV0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CEP164Q9UPV0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CEP164Q9UPV0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC38.57■■■■□ 3.77
CEP164Q9UPV0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
CEP164Q9UPV0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CEP164Q9UPV0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CEP164Q9UPV0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CEP164Q9UPV0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CEP164Q9UPV0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
CEP164Q9UPV0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CEP164Q9UPV0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CEP164Q9UPV0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CEP164Q9UPV0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CEP164Q9UPV0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CEP164Q9UPV0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
CEP164Q9UPV0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CEP164Q9UPV0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CEP164Q9UPV0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CEP164Q9UPV0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CEP164Q9UPV0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CEP164Q9UPV0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CEP164Q9UPV0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CEP164Q9UPV0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CEP164Q9UPV0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
CEP164Q9UPV0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CEP164Q9UPV0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CEP164Q9UPV0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CEP164Q9UPV0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CEP164Q9UPV0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CEP164Q9UPV0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CEP164Q9UPV0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CEP164Q9UPV0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CEP164Q9UPV0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CEP164Q9UPV0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CEP164Q9UPV0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CEP164Q9UPV0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CEP164Q9UPV0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms