Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMG5Q9UPR3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMG5Q9UPR3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms