Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FZD4Q9ULV1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FZD4Q9ULV1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FZD4Q9ULV1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FZD4Q9ULV1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FZD4Q9ULV1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FZD4Q9ULV1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms