Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDH9Q9ULB4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDH9Q9ULB4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms