Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DNAJB4Q9UDY4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DNAJB4Q9UDY4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms