Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD71

PPP1R1B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1BQ9UD71 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PPP1R1BQ9UD71 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPP1R1BQ9UD71 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms