Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
APEX2Q9UBZ4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APEX2Q9UBZ4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms